魔术快斗1412与魔术快斗两者不是同一个制作公司,前者是A-1 Pictures,后者是TMS。魔术快斗1412是一部独立的动画,与TMS的魔术快斗无关,二者都不影响柯南剧情。因为制作公司、制作团队不同,导致二者的画风、故事风格、制作水平、人物设定、音乐、集数、故事顺序等都不同,部分角色的配音也不同等等。但因为都改编自青山刚昌的魔术快斗漫画,所以部分情节会有重复。
另外魔术快斗1412中会有将名侦探柯南中基德登场的案件、以基德视角进行重新描绘的故事,是与TMS的最大不同点之一。
可以将它当做一部独立的动画来看待