中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入

中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入 本文关键词：图谱，指纹，导入，中药，文本

中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入 本文简介：中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入话说很多同行都无法将高效液相，气相，气质联用跑出来的色谱图导入到指纹图谱相似度分析软件进行分析。

目前对谱图相似度分析的软件也只有接下来几个版本：、B版》、药检所版的《中药色谱图分析和数据管理系统》、浙大版的《中药指纹图谱相似度计算软件》及中南版的《相似度分析软件

中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入 本文内容：

中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入

话说很多同行都无法将高效液相，气相，气质联用跑出来的色谱图导入到指纹图谱相似度分析软件进行分析。

目前对谱图相似度分析的软件也只有接下来几个版本：、B版》、药检所版的《中药色谱图分析和数据管理系统》、浙大版的《中药指纹图谱相似度计算软件》及中南版的《相似度分析软件》，在写这边帖子之前，前三个版本我都反复安装试过很多次，第四个一方面需要matlab的只是、另一方我也没有在网上找到资源。

最后我选择了使用药典版的《中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版》，以下简称

图1

第一步，导出text文件，做好准备工作

打开GCMSSolution软件，导出你需要处理的图谱

2

1

图4

这样导出的TXT包括了两部分：定性峰表信息

1

2

图7

有用的数据就是色谱图数据中的时间列（即本例中的第一列）和信号列（即本例中的第二列）及积分数据中的峰序号（即本例中的第一列）、保留时间（即本例中的第二列）、峰高（即本例中的第七列）和峰面积（即本例中的第六列）【一共六列】。

那么在“我的数据表”中就提取这些信息即可。如图8

图8

PS：文后附上例子中的Excel表，熟悉的可以自己编辑，不熟悉的也没关系，看了就能懂。

好了，小插曲结束，继续正题。

首先，新建一个TXT文件，用以存储你提取的有用信息。

命名好后（TEST1.txt），分别按照标准文本文件格式的信息输入，及先把指纹图谱采样号数据（即色谱图数据）复制粘贴到TEST1.txt文件中，然后再后面复制粘贴上指纹图谱积分数据（即积分数据）。这样就把TXT文本的信息编辑好了，那么接下来应该做什么呢？导入《A系统》试试，对就是这样的。我们导入进去试试，结果奇怪的事情发生了，怎么会多一条直线呢，如图9。

图9

接下来的就是第三部需要解决的问题，最关键也是最简单的一步

第三步，删除作怪空格，给图以原貌

将text1.txt打开，发现有图10的四行中文字，它没有错，错就错在图11，也就是它在作怪。

图10

是不是发现指纹图谱积分数据那两行都多了很多空格，删除。

再导入到《A系统》试试，得到图12的结果

图11

是不是发现自己很厉害，祝贺你，成功了。就是这样编辑的。

但是图12看起来你可能也会觉得很奇怪，后面那么多空白，没关系，图都能够弄出来，还怕这点小问题吗？

重启《A系统》，重新导入，看看图13.

图12

图13

恭喜你，可以开始做图谱相似度分析了。

如有疑问可QQ:251542282或

email：cn_yzl@126.com