Simone
传统上，辐鳍鱼分为三个类群：软骨硬鳞附类、全骨附类和真骨附类。一些形态学上的证据认为第二类为并系群，所以应该废除；然而，最近从完整粒线体基因中来分析DNA序列的研究却倾向支持第二类的存在。几乎所有现存的硬骨鱼类皆为真骨附类。
以下是辐鳍鱼纲分类的列表，各阶层的排列顺序均依演化顺序排列：
软骨硬鳞亚纲 Chondrostei
多鳍鱼目: Polypteriformes
鲟形目:Acipenseriformes
新鳍亚纲 :Neopterygii
全骨下纲 :Holostei
雀鳝目 :Lepisosteiformes
弓鳍鱼目: Amiiformes
真骨下纲:Teleostei
骨舌鱼总目: Osteoglossomorpha
骨舌鱼目: Osteoglossiformes
月眼鱼目: Hiodontiformes（如：海鲢）
海鲢总目 Elopomorpha
海鲢目 Elopiformes
北梭鱼目 Albuliformes
鳗鲡目 Anguilliformes
囊鳃鳗目 Saccopharyngiformes
鲱形总目 Clupeomorpha
鲱形目 Clupeiformes
骨鳔总目 Ostariophysi
鼠鱚目 Gonorynchiformes
鲤形目Cypriniformes
脂鲤目 Characiformes
裸背鱼目 Gymnotiformes
鲶形目 Siluriformes
原棘鳍总目 Protacanthopterygii
鲑形目 Salmoniformes
狗鱼目Esociformes
胡瓜鱼目 Osmeriformes
巨口鱼总目 Stenopterygii
辫鱼目 Ateleopodiformes
巨口鱼目 Stomiiformes
圆鳞总目 Cyclosquamata
仙女鱼目 Aulopiformes（如:斑点灯笼鱼）
灯笼鱼总目 Scopelomorpha
灯笼鱼目 Myctophiformes
月鱼总目Lampridiomorpha
月鱼目 Lampriformes
须鳂总目 Polymyxiomorpha
须鳂目 Polymixiiformes
副棘鳍总目 Paracanthopterygii
鲑鲈目Percopsiformes
蟾鱼目 Batrachoidiformes
鮟 目 Lophiiformes
鳕形目 Gadiformes
鼬鱼目 Ophidiiformes（如:乌鱼）
棘鳍总目 Acanthopterygii
鲻形目 Mugiliformes
银汉鱼目 Atheriniformes
鹤鱵目 Beloniformes
鲤齿目 Cyprinodontiformes
奇鲷目 Stephanoberyciformes
金眼鲷目 Beryciformes
海鲂目 Zeiformes
棘背鱼目 Gasterosteiformes
合鳃目 Synbranchiformes
鲀形目 Tetraodontiformes
鲽形目Pleuronectiformes
鲉形目 Scorpaeniformes
鲈形目 Perciformes
