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首都儿科研究所附属儿童医院（儿研所）是三级甲等医院、爱婴医院。医院分为：儿研所总院和儿研所月坛门诊部两个院区。儿研所编制床位 300张，设有内科、外科、急诊科、保健科、耳鼻喉科、口腔科、眼科、中医科、皮肤科等临床科室，并根据儿童发病特点开设了呼吸、神经、心血管、新生儿、血液、消化内科，新生儿外科、普外、泌尿外科，生长发育、营养、智力测查等20多个专业，及哮喘、血管瘤等6个专病门诊。
儿研所还建有特需门诊、A 级病房及计算机远程医疗咨询会诊中心。北京儿研所医院拥有CT、彩超、动态心电、脑电图系统、诱发电位、自动生化分析仪等各种先进的检查、诊断设备。
专家门诊应诊专家80余人，其中特级专家12人。北京儿研所医院平均年门诊量70余万人次，年住院病人6000余人次。儿研所2002年初，在北京市政府、市卫生局及社会各界的关心支持下，北京儿研所附属儿童医院 11000平方米的新门诊楼落成，新门诊楼的建成具现代儿童医院特点，突出“以人为本”的新理念，为小患者营造了温馨、舒适、便利的就诊环境和就医条件。
