对基辛格影响最大的是他的前后两任妻子。基辛格的第一位妻子名叫安娜・佛莱彻尔,也是犹太人,与基辛格生有一儿一女,是位相夫教子的贤妻良母。基辛格在哈佛大学教学时尚未出名,为了拿到终身教授位子而苦苦挣扎,经常是关在书房足不出屋。而安娜则精心照料丈夫的起居。基辛格除了埋头写书外,还得拉关系,时而得在家里举行聚会宴请同事、学生。安娜总是尽心尽意地做好女主妇。
但基辛格得道之后便以感情不合为名,与安娜分道扬镳。其实,基辛格当初与安娜谈恋爱时便开始寻花问柳。当时基辛格是美国陆军的一名伍长,因为会讲德文而在驻德美军中担任情报工作,负责搜捕纳粹余孽。安娜则仍在纽约读书,照料基辛格的父母。美国陆军的条例明文规定,美国官兵不得与当地妇女相从过密。但基辛格还是找了位金发碧眼的德国妇女同居,两人出双入对,经常举行宴会,款待来宾。
基辛格最后选定的伴侣是南希・马格瑟斯。这是位身材高挑的英伦三岛移民后裔,在美国算是正宗白人。南希原是美国石油大王洛克菲勒的幕僚。基辛格为洛克菲勒主持外交研究时结识了这位丽人,之后苦追不舍。南希终于心动,放弃了在加州伯克莱分校攻读博士学位的学业,与基辛格结为伉俪。 至今健在。
基辛格的第二任夫人南希·基辛格(本名南希·马格瑟斯)仍然健在,她是1934年生的,是著名的慈善活动家。